Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria3Q9Z2W9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria3Q9Z2W9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms