Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt85Q9Z2T6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms