Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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