Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vamp5Q9Z2P8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms