Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Robo3Q9Z2I4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Robo3Q9Z2I4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Robo3Q9Z2I4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Robo3Q9Z2I4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Robo3Q9Z2I4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms