Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccne2Q9Z238 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms