Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip6Q9Z1Y4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip6Q9Z1Y4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms