Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3b1Q9Z1T1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms