Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ror1Q9Z139 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms