Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NgfrQ9Z0W1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms