Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn13Q9Z0S4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms