Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip2Q9Z0H8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms