Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AireQ9Z0E3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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AireQ9Z0E3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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