Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms