Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf2Q9WTU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms