Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms