Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb3Q9R1P1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms