Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms