Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms