Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms