Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vav3Q9R0C8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms