Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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