Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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