Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Col4a4Q9QZR9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Col4a4Q9QZR9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Col4a4Q9QZR9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Col4a4Q9QZR9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Col4a4Q9QZR9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a4Q9QZR9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms