Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Copg1Q9QZE5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copg1Q9QZE5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms