Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ChmlQ9QZD5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChmlQ9QZD5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChmlQ9QZD5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ChmlQ9QZD5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ChmlQ9QZD5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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