Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Foxe3Q9QY14 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Foxe3Q9QY14 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms