Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms