Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms