Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Homer2Q9QWW1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms