Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms