Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdc42ep4Q9JM96 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms