Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms