Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm1Q9JLF6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm1Q9JLF6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms