Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ap3m1Q9JKC8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms