Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msgn1Q9JK54 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms