Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gfra4Q9JJT2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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