Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms