Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf2ird1Q9JI57 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf2ird1Q9JI57 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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