Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tnfrsf13bQ9ET35 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tnfrsf13bQ9ET35 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tnfrsf13bQ9ET35 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfrsf13bQ9ET35 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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