Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms