Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn10Q9ESK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn10Q9ESK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms