Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ush1cQ9ES64 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ush1cQ9ES64 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms