Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Wdr61Q9ERF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms