Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx18Q9EPZ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Tbx18Q9EPZ6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx18Q9EPZ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms