Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tlr1Q9EPQ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms