Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl4Q9DCU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl4Q9DCU6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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