Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk1dQ9DC28 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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