Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms