Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms